王健林退出足球的原因主要有以下几点：

对裁判判决不满：

王健林曾因为在赛后的发布会上怒斥球场黑暗，并宣布永远退出中国足坛。

足球管理制度问题：

王健林认为足球管理机构是官办的，而管理的事情是市场化的，这种体制和市场化的运动存在很大的矛盾。管理部门是任命的，而不是选出来的，这很难调和。

赌博集团渗透：

王健林判断赌博行业已经渗透到中国足球这个行业里，有赌球的，而且影响了赛场的一些比赛。他曾向体育总局的主管领导反映过，但都没有被采纳。

对国内足坛腐败的失望：

王健林对国内足坛的腐败现象感到失望，认为再继续投资足球是白费精力。

综合以上几点，可以看出王健林退出足球的原因是多方面的，包括对裁判判决的不满、足球管理制度的矛盾、赌博集团的渗透以及对国内足坛腐败的失望。