水户市有两所著名的大学：

水户国际日本语学校：

创立于1988年，是一所日本语教育振兴协会认定校，也是东京入国管理局认定的优良校。学校位于日本茨城县水户市，提供日语教育。

茨城大学：

简称茨大，是一所位于日本茨城县水户市的国立大学。学校以面向新时代为前提，展开教育和研究，并在各领域发表领先世界的研究成果，推动社会的学术文化等方面的发展。

根据以上信息，水户市主要的两所大学分别是水户国际日本语学校和茨城大学。