穆里尼奥离开皇马的原因是多方面的，主要包括以下几点：
与球员的矛盾：
穆里尼奥在皇马执教期间，与多名球员产生了矛盾。特别是与卡西利亚斯、拉莫斯等队内大佬的关系紧张，卡西“内鬼”事件成为直接导火索。此外，穆里尼奥与C罗在战术方面也存在分歧，以及与卡卡关于伤病的处理也产生了矛盾。
管理层的压力：
穆里尼奥在皇马期间，面临着巨大的成绩压力，导致他对球员们的情绪不稳定。同时，他与媒体的关系紧张，家人也不适应马德里生活，这些因素都加剧了他的压力。
未能实现欧冠冠军的梦想：
穆里尼奥在皇马期间，虽然率队夺得了西甲和国王杯冠军，但未能自2002年之后第10次问鼎欧冠冠军，这可能是他离开皇马的一个重要原因。
个人选择：
穆里尼奥在西班牙度过了3年后，想要回到切尔西。他认为留在皇马是正确的决断，但内心决定的选择是回到切尔西。
其他因素：
穆里尼奥还因为对皇马未来成就的预见，以及对自己在皇马未竟事业的遗憾，最终选择离开。
总的来说，穆里尼奥离开皇马的原因是多方面的，包括与球员的矛盾、管理层的压力、未能实现欧冠冠军的梦想、个人选择以及其他因素。这些因素共同作用，最终导致他在2013年选择离开皇马。