朱芳雨没有进入国家队的原因主要是 伤病和状态问题。

伤病原因：

朱芳雨的膝伤一直没有完全康复，为了他的长期生涯考虑，教练组决定不让他参加世锦赛等重要比赛。

状态问题：

尽管医生表示朱芳雨可以上场比赛，但由于伤病影响，他的状态并不理想。教练组出于保护球员的考虑，没有让他参加国家队。

教练的用人标准：

主教练邓华德有自己的一套用人标准，朱芳雨需要符合他的战术思想和队伍要求。由于朱芳雨长时间征战赛场，留下的伤病问题以及归队时间较晚，导致他能否跟上队伍的要求成为了一个重要考量因素。

综上所述，朱芳雨没有进入国家队的主要原因是伤病和状态不佳，同时也受到教练用人标准的影响。