武汉卓尔职业足球俱乐部有限公司是 卓尔控股旗下的全资子公司，不属于国企。武汉卓尔控股有限公司成立于2005年，总部位于湖北武汉，是一家专注于投资、开发及经营高品质、大规模的交易平台及公用物业项目的公司。2011年，卓尔控股全面接手湖北武汉足球队，并成立了武汉卓尔职业足球俱乐部有限公司。
卓尔控股董事局主席阎志表示，公司将在球队建设、引进外援、硬件设施上加大投入，以使卓尔队的配置和水平能配得上武汉这座伟大的城市。俱乐部当期目标是全力冲超，并对球队未来发展做出10年乃至20年的系统规划。
此外，武汉卓尔职业足球俱乐部有限公司在2021年2月15日宣布更名为“武汉足球俱乐部有限公司”，以符合中国足协关于俱乐部名称非企业化的要求。