托蒂在2008年4月19日对利沃诺的比赛中受伤， 经初步诊断，他遭受了右膝扭伤以及前十字韧带损伤。托蒂在比赛中表情痛苦，随后被担架抬下场。赛后，斯帕莱蒂宣布托蒂将在几天后进行手术，并估计他将因此休战半年。实际上，在下场之前，托蒂的右膝已经感到不适，罗马的首席队医布鲁佐解释说，托蒂第一次下场疗伤时，膝盖只是有些青肿，但他选择继续比赛。后来，他在一次踢球时再次弄伤了膝盖，随后决定立刻将他抬下场。
托蒂于2008年4月20日在罗马斯图尔特别墅诊所接受了手术，修复了撕裂的右膝前十字韧带。医生估计他需要休息约4个月，直到当年9月才能复出。这已经是托蒂职业生涯中的第二次重伤。托蒂上次重伤发生在2006年2月19日，当时他被恩波利后卫瓦尼利踢断踝骨。
托蒂的伤病对他在赛季中的表现产生了重大影响，他因此错过了多个比赛，并在赛季结束后进行了手术。尽管如此，托蒂展现出了顽强的斗志和恢复能力，在手术后不久便返回了训练场，并在2008年9月成功复出。