孔令辉与马苏未能结婚的原因主要有以下几点：

事业优先：

孔令辉和马苏在各自的事业上升期，都将大部分精力投入到了工作中，导致他们很少有时间在一起，感情因此变淡。

聚少离多：

两人长期处于分离状态，感情逐渐淡化。孔令辉曾放话北京奥运会后一定娶马苏，但等到伦敦奥运会结束后，两人仍未结婚，中间还屡传分手。

性格和选择：

孔令辉可能希望未来的妻子能够与自己成为势均力敌的对手，因此在选择伴侣时更为谨慎。而马苏一直以事业为由多次拒绝孔令辉的求婚，这也可能是两人未能结婚的原因之一。

其他因素：

也有观点认为，马苏在娱乐圈的繁忙行程使她无法为了爱情放弃事业，这可能是两人一直没有结婚的重要原因。

综上所述，孔令辉和马苏未能结婚的原因是多方面的，包括事业、时间和性格等方面的因素。