佩佩决定不续签的原因主要有以下几点：

俱乐部层面的决策：

波尔图新任主席博阿斯在竞选中胜出后，出于阵容年轻化的考虑，决定不与佩佩续约。

个人职业规划：

尽管佩佩在波尔图的表现依旧稳健，但他选择退出国家队，为年轻球员让出位置。

状态与年龄：

佩佩虽然状态出色，但已41岁，考虑到年龄因素，他可能认为自己的职业生涯已经达到了一个阶段，应该让给更有活力的年轻球员。

其他俱乐部的兴趣：

尽管佩佩目前是自由身，但巴甲球队瓦斯科达伽马曾向其提供合同，不过被佩佩拒绝。

综上所述，佩佩不续签的原因是多方面的，包括俱乐部的决策、个人的职业规划、年龄因素以及其他俱乐部的兴趣等。