孙可之所以在中超沦为替补，主要原因可以归纳为以下几点：
伤病影响：
孙可在加盟权健后一直受到伤病的困扰，这导致他的竞技状态大幅下滑。几次大伤病使得他逐渐失去了主力位置，长时间打不上比赛，从而影响了他的职业生涯。
球队战术调整：
随着权健从中甲升级到中超，球队在战术上进行了调整，引入了其他球员如姚翰林、邓卓翔等，这些新球员的加入使得孙可的位置变得不再稳固，逐渐从主力变成了替补。
年龄和身体因素：
孙可随着年龄的增长，身体素质和对抗能力逐渐下降，已经不再适应现代足球的高强度要求。在激烈的比赛中，他很难保持最佳状态，这也使得他逐渐失去了主力的位置。
心理和情感因素：
孙可作为江苏苏宁的昔日队长，对球队和球迷有着深厚的感情。他选择加盟深圳佳兆业，可能是因为在那里他可以继续与一些熟悉的队友一起踢球，享受职业生涯的最后阶段。
综上所述，孙可沦为替补主要是由于伤病、球队战术调整、年龄和身体因素以及心理和情感因素等多方面原因共同作用的结果。