曾令旭考上清华大学的过程如下：

参加清华的全国测试：

曾令旭首先参加了清华大学的全国测试，并获得了认定书。

参加高考：

在获得清华的认定书后，曾令旭参加了高考，并且成绩达到了清华的录取分数线。

体育特长生的身份：

曾令旭作为体育特长生，在高考前奔波于各大院校进行试训，并在试训清华时被当时的主帅看重。

高考前的挑战：

在高考前几天，曾令旭突然被检查出急性阑尾炎，医生建议手术治疗，但这会影响高考。曾令旭在高考时强忍疼痛，最终成功考取了清华大学。

文化课学习：

曾令旭的母亲非常重视他的文化课学习，并没有因为他是运动员而放松对他的教育。曾令旭在小学时期就是丹东著名的球星，但母亲坚持让他读书，最终他成为运动员和学者两不误的典型例子。

综合以上信息，曾令旭通过参加清华的全国测试、高考、体育特长生的身份以及克服高考前的健康挑战，成功考上了清华大学。同时，他的母亲在文化课学习上的坚持也为他的成功打下了坚实的基础。