柔佛队不参加亚冠的原因主要有以下几点：

政府限制：

由于马来西亚政府的限制出境政策，柔佛队未能获得前往卡塔尔多哈参加亚冠的许可。

疫情影响：

新冠疫情导致马来西亚实施了严格的防疫措施，包括禁止所有外国旅客入境和限制民众出国旅行，这对柔佛队出国参赛造成了严重影响。

竞争力不足：

尽管柔佛队在马来西亚联赛中表现出色，但在亚冠联赛中由于整体实力较弱，未能取得理想的成绩。

综上所述，柔佛队不参加亚冠主要是由于马来西亚政府的限制政策和新冠疫情的影响。