上港选择苏宁作为亚冠16强淘汰赛的对手，主要基于以下几个方面的考虑：

苏宁的竞技状态：

尽管苏宁在联赛中表现不佳，但在亚冠赛场上表现出色，五胜一负的战绩显示了其在亚洲赛场的竞争力。上港认为苏宁在联赛中的表现并不能真实反映其真实实力，因此选择苏宁作为对手可以避免在联赛中消耗过多精力。

赛程安排：

上港在小组赛阶段表现出色，而苏宁则面临连续三个客场的挑战，包括广州、上海和贵州。上港选择苏宁可以避免在淘汰赛阶段面对更为艰难的对手，同时利用苏宁的疲劳状态，争取在首回合取得优势。

战略考虑：

上港在首回合比赛中取得了胜利，并且掌握了客场进球的优势。选择苏宁作为对手，可以使上港在第二回合的比赛中占据主动，只需一球小胜即可晋级。此外，上港在联赛中的赛程相对轻松，而苏宁则需要面对多线作战的压力，上港的选择可以在战略上占据优势。

避免舟车劳顿：

由于南京和上海之间的距离较近，上港选择苏宁可以避免长途旅行的疲劳，保持球队的最佳状态。

心理战和球迷支持：

苏宁在联赛中的表现不佳，但亚冠赛场上表现出色，获得了中立球迷的支持。上港的选择可能会引发一些争议，但也可以激发球迷的热情和支持。

综上所述，上港选择苏宁作为亚冠16强淘汰赛的对手，是基于苏宁在亚洲赛场的竞争力、赛程安排、战略考虑、避免舟车劳顿以及心理战和球迷支持等多方面的综合考虑。