迈克尔·乔丹在1998年选择退役的原因是多方面的，主要包括以下几点：
NBA大停摆：
1998年NBA遭遇大停摆，赛季无限期暂停，这对乔丹的退役决定产生了影响。
球队解体：
在1998年全明星赛前，芝加哥公牛队的解散已成定局，禅师菲尔·杰克逊决定离开，皮蓬的合同到期且球队无意续约，罗德曼的伤病问题严重，球队不愿意继续投资。
个人状态下滑：
乔丹当时已经35岁，虽然依旧保持着较高的竞技水平，但身体素质和表现已经开始下滑，季后赛的表现尤其艰难。
管理层的决策：
公牛队老板杰里·克劳斯希望重建球队，以年轻球员为核心，追求商业利益，这与乔丹希望保持球队竞争力的愿望相冲突。
对篮球的挑战减少：
乔丹感到在联盟中难以找到能挑战自己的对手，这让他认为已经没有了起初作为篮球运动员时的挑战目标。
支持球员工会：
乔丹在停摆期间宣布退役，以表示对球员工会的支持。
其他因素：
乔丹与球队管理层，特别是老板克劳斯之间的关系并不融洽，这可能也是他选择退役的一个原因。
综合以上因素，乔丹在1998年选择退役是一个由多方面原因共同作用的结果