当NBA球队的工资总额超过工资帽时，会面临一系列后果和限制，具体如下：
奢侈税：
球队需要向联盟缴纳奢侈税。奢侈税是一种附加费用，超过工资帽部分的薪金将按照一定比例纳税。纳税比例随着超支金额的增加而逐渐上升。
罚款：
当球队超支时，NBA将对球队征收高额罚款。罚款金额通常是超支部分的倍数，具体数额取决于超出工资帽的程度。
限制签约和交易：
超过工资帽的球队将面临签约和交易的限制。他们不能以超过最大合同金额的方式向自由球员提供合同，并且在进行球员交易时需要遵守更为严格的规定。
重建限制：
超过工资帽的球队可能会受到重建限制，这意味着他们无法通过自由市场签约顶级球员或者以高薪吸引优秀球员，从而限制了球队重建的能力。
第三方托管：
在特定情况下，如1999年NBA球员工会和官方达成的协议，球员薪金的10%会被放入托管账户中。如果球员最后的收入没有超过联盟总收入的55%，那么托管的钱将原数奉还；如果超过55%，那么这笔钱将被没收。
特定条款例外：
尽管存在工资帽的限制，但NBA也设定了一些例外条款，如拉里·伯德条款，允许某些符合条件的自由球员在续约时获得更高的工资增长幅度。
新秀合同：
即使球队超过工资帽，他们仍然可以用新秀合同签下当年选中的新秀。新秀合同通常是一个2+2合同，后两年为球队选项。
综上所述，当NBA球队的工资总额超过工资帽时，他们需要采取一系列措施来应对，包括缴纳奢侈税、面临罚款和交易限制等。这些规定旨在确保所有球队都在同一起跑线上竞争，并防止一些球队无限制地组建多巨头球队，从而维持NBA的财务稳定和竞争公平性。